I cinque atomi di carbonio si uniscono a formare una struttura ad anello chiusa da un atomo di ossigeno, intorno alla quale si dispongono i restanti atomi. Il carbonio in posizione 3' lega ad un gruppo -OH di un gruppo fosfato che, a sua volta, lega in posizione 5' di un nucleotide adiacente. Trovandosi in posizione finale lungo la catena di DNA, il deossiribosio sostituisce il gruppo fosfato in posizione 5' con un gruppo -OH (al contrario, in posizione iniziale il deossiribosio possiede un normale legame 3' con un gruppo fosfato che, tuttavia, non lega con nessun altro composto).